輪狀病毒疫苗於2006年上市後，RotaTeq（五價輪狀病毒疫苗）以及Rotarix（單價輪狀疫苗病毒）受到WHO的推薦，建議施打於所有的小孩身上，以預防嚴重兒童腹瀉。
儘管輪狀病毒疫苗在上市前的研究並無發現有增加腸套疊風險的機率，上市後研究指出有可能有些微增加腸套疊的機率。
在最近一期的NEJM中，有研究者指出5價輪狀病毒疫苗會增加腸套疊的機率[1]。研究囊括了三個美國FDA贊助的醫療計畫中，5週~36.9週的小朋友，時間從2004年到2011年中，合計五十萬名第一次施打五價輪狀病毒疫苗者，以及五萬多名第一次施打單價輪狀疫苗者。統計結果發現，施打五價輪狀病毒的小朋友，發生腸套疊的機率會增加，大约每十萬人會增加1.5個案例（95% CI, 0.2 to 3.2）。而單價輪狀病毒的統計效力不足。
同一期期刊中，另一群作者[2]蒐集了VSD（Vaccine Safety Datalink）計畫的6個整合資料庫，時間從2008年四月到2013年三月。他們回顧4週到34週的嬰兒在施打單價輪狀病毒疫苗後的七天醫療記錄，結果發現施打疫苗造成腸套疊的可歸因風險約為每十萬名施打的嬰兒會增加5.3例。
儘管腸套疊的發生機率上升，輪狀病毒疫苗對於感染的預防仍然功不可沒。舉例而言，美國每年出生四百萬名嬰兒，疫苗的施打估計可與避免將近五萬多名嬰兒住院，以及十七萬名嬰兒因腹瀉造訪急診，代價是45到213名腸套疊的患者。[3]
目前仍有許多問題有待解決：造成腸套疊的機制是甚麼？能否分辨出較容易發生腸套疊的族群？這些有待更進一步的研究。
Reference
1. Intussusception Risk after Rotavirus Vaccination in U.S. Infants. Yih WK, Lieu TA, Kulldorff M, Martin D, McMahill-Walraven CN, Platt R, Selvam N, Selvan M, Lee GM, Nguyen M. N Engl J Med. 2014 Jan 14. [Epub ahead of print]
2. Risk of Intussusception after Monovalent Rotavirus Vaccination. Weintraub ES, Baggs J, Duffy J, Vellozzi C, Belongia EA, Irving S, Klein NP, Glanz JM, Jacobsen SJ, Naleway A, Jackson LA, Destefano F. N Engl J Med. 2014 Jan 14. [Epub ahead of print]
3. Estimates of benefits and potential risks of rotavirus vaccination in the U.S. Presented at the Advisory Committee on Immunization Practices Meeting, Atlanta, Cortese M. June 20, 2013 (http://www.cdc.gov/vaccines/acip/meetings/slides-jun-2013.html).
4. Rotavirus Vaccines - Balancing Intussusception Risks and Health Benefits. Glass RI, Parashar UD. N Engl J Med. 2014 Jan 14. [Epub ahead of print]
